Za vrijeme posjeta Zemlji, skupina vanzemaljaca biva slučajno otkrivena od skupine ljudi. U panici, oni pobjegnu u svoj brod i napuste Zemlju, no zaboravili su na malenog vanzemaljca, koji se tada nađe posve sam, ostavljen, na njemu nepoznatom planetu, daleko od doma. Na svu sreću, on ubrzo...
Prošle su četiri godine otkad su agenti uspjeli spriječiti međugalaktičko uništenje. Kay je opet civil, a Jay i dalje radi za Ljude u crnom. Dok istražuje rutinski zločin, Jay otkriva strašan plan zla čudovišta koje se prerušilo u zgodnu manekenku. Vremena je sve manje i Jay mora...
Jednog jutra 1928. u radničkom predgrađu Los Angelesa Christine odlazi na posao i pozdravlja sina. Kada se vrati kući, njenog sina nema. Potraga za njim traje godinama i Christine napokon dobiva informaciju da će joj sin biti vraćen. No, Christine umjesto sreće zbog povratka djeteta doživi...
